M系
G系エンジンの後継で、燃費や排ガスといった基本性能を高いレベルで達成しつつ、動力性能、静粛性、信頼性のバランスを図ったエンジン。アルミダイキャスト製の4気筒DOHC 16バルブエンジンで、高剛性のセミラダーフレーム式クランク軸受、スリーブを直接冷却するセミウエットライナー方式等を特長とし、国内向けには吸気VVTを標準装備とした。加工方法の改良によりシリンダボアの真円度が向上し、オイル消費量及びブローバイガスの削減とピストンリングの低張力化が実現できた。またサイレントチェーンの採用やヘッドカバーの騒音対策により、エンジンの静粛性を大きく向上させた。
M13A
（スイフトHT型）
2000年発売のスイフト（HT型）のために開発した、新設計1.3LオールアルミDOHCエンジン。
| エンジン型式 | M13A |
| エンジン種類 | 水冷 4サイクル 直列4気筒 |
| 弁機構 | DOHC 16バルブ |
| 内径（mm）×行程（mm） | 78.0×69.5 |
| 総排気量（cc） | 1,328 |
搭載車一覧 [※]
| 機種名 発売年 | 搭載期間 | |
| スイフト（HT型） 2000 | 2000年2月 | 2004年11月 |
| スイフト 2004 | 2004年11月 | 2010年9月 |
| ジムニーワイド 1998 | 2000年4月 | 2002年1月 |
| ジムニーシエラ 2002 | 2002年1月 | 2018年7月 |
| ワゴンRソリオ 2000 | 2000年12月 | 2005年8月 |
| ソリオ 2005 | 2005年8月 | 2010年12月 |
M15A
（エリオ）
2001年発売のエリオに初搭載された。SX4の2009年の一部改良時には、可変吸気システムを採用して出力・トルクを向上させた。
| エンジン型式 | M15A |
| エンジン種類 | 水冷 4サイクル 直列4気筒 |
| 弁機構 | DOHC 16バルブ |
| 内径（mm）×行程（mm） | 78.0×78.0 |
| 総排気量（cc） | 1,490 |
搭載車一覧 [※]
| 機種名 発売年 | 搭載期間 | |
| エリオ 2001 | 2001年1月 | 2006年7月 |
| エリオセダン 2001 | 2001年11月 | 2007年7月 |
| スイフトスポーツ（HT型） 2003 | 2003年6月 | 2004年11月 |
| スイフト 2004 | 2004年11月 | 2010年9月 |
| SX4 2006 | 2006年7月 | 2014年11月 |
| SX4セダン 2007 | 2007年7月 | 2014年11月 |
M18A
（エリオ）
2003年、エリオとエリオセダンに追加された1.8Lのハイグレードエンジン。
| エンジン型式 | M18A |
| エンジン種類 | 水冷 4サイクル 直列4気筒 |
| 弁機構 | DOHC 16バルブ |
| 内径（mm）×行程（mm） | 83.0×83.0 |
| 総排気量（cc） | 1,796 |
搭載車一覧 [※]
| 機種名 発売年 | 搭載期間 | |
| エリオ 2001 | 2003年1月 | 2007年7月 |
| エリオセダン 2001 | 2003年1月 | 2007年7月 |
M16A
（スイフトスポーツ 2011年）
2011年発売のスイフトスポーツには、可変吸気システムの他、数々の専用チューニングを施して出力100kWを達成したM16Aが搭載された。M16A は2020年3月現在、SX4 S-CROSSに搭載されている。
| エンジン型式 | M16A |
| エンジン種類 | 水冷 4サイクル 直列4気筒 |
| 弁機構 | DOHC 16バルブ |
| 内径（mm）×行程（mm） | 78.0×83.0 |
| 総排気量（cc） | 1,586 |
搭載車一覧 [※]
| 機種名 発売年 | 搭載期間 | |
| スイフトスポーツ 2005 | 2005年9月 | 2011年12月 |
| スイフトスポーツ 2011 | 2011年12月 | 2017年9月 |
| エスクード3ドア 2006 | 2006年6月 | 2007年5月 |
| エスクード （4代目） 2015 | 2015年10月 | 2018年12月 |
| SX4 S-CROSS 2015 | 2015年2月 | 継続中 |